一九九七年——衆格鬥家的決勝戰之後，高尼茨突然出現的破壞引起了很大的回應，市民爭相希望了解，當天究竟發生了什麽事情。主辦機構亦忙于向那次特別事件作出解釋（說是由恐怖分子引起的事端）及處理善後的問題。
K.O.F.96大會的成功，不單引起了格鬥潮流，更引起了數間巨大企業的興趣，並以贊助者的名義期望舉辦K.O.F.97，K.O.F.97之聲勢就此日漸壯大。在一遍群情洶湧下，K.O.F.97正式落實舉行了。大會決定舉辦後，世界各地的武道家都會紛紛雲集。在大賽前，與草薙京有著宿世姻緣的女友雪登場，同時京的徒弟——十分仰慕他的矢吹真吾也出現在大衆面前，京傳授了他草薙流古武術。
經過激烈比賽，大會結束，此時庵、莉安娜體內的邪惡力量突然爆發。在擊敗暴走的兩人後，在大會中引人注目的七枷社、夏爾米、克裏斯登場，這三人的真正身份竟然是大蛇一族的四天王。一番激戰後戰勝了三人，而這時候大蛇藉克裏斯的身體轉生成功！傳說之中最強的暗黑力量主人——大蛇OROCHI終于出現了！最終OROCHI敗于三神器的京、庵、千鶴的手上。大傷元氣的庵被千鶴救回神舍修養，而重傷的京則被N.E.S.T.S.組織生擒回去，成爲制造複制人的素材……
拳皇97裏的格鬥隊伍共分爲九組，分別是：(1)主人公隊、(2)餓狼傳說隊、(3)龍虎之拳隊、(4)怒隊、(5)超能力戰士隊、(6)新女性格鬥家隊、(7)金隊、(8)新面孔隊、(9)97特別隊。
除此之外，遊戲裏的格鬥角色不僅局限于上述參賽隊伍，另外還有個人參賽角色：八神庵、矢吹真吾，以及7個隱藏角色：94Ver.京、月之夜大蛇之血發狂的庵、暗黑之中大蛇之血覺醒的蕾歐娜、幹涸大地之社、荒狂稻光之夏爾米、炎之宿命之克裏斯以及大蛇。
草雉京（火神。。。）
外式 轟斧陽 →+K
奈落落（跳躍中 ↓+U
八拾八式 ↓+→+I
荒咬 ↓→·J （沖打）
動作中J或U
毒咬 ↓→·U（沖打）
毒咬中 →↓←J或U
荒咬中↓→·J或U
可接 J K或K I
荒咬中→↓←J或U
罰詠中 →J或U
鶴摘↓←J或U （被動技能）
*大招 大蛇雉↓←→·J或U
無式↓→↓→·J或U
二階堂紅丸 （電神。。。）
傑克小刀踢 →+K
旋轉膝落（跳躍中） ↓+I
雷韌拳 ↓→·J或U
真空片手駒 ↓←·J或U （轉！）
超級閃電踢 →↓→·K或I （放空電柱）
飛之技巧 ↑以外·U或I（一定程度上向上踢）
空中雷韌拳（跳躍中） ↓→·J或U
居合蹴 ↓→·K或I
反動三段蹴 →↓←·K或I
紅丸投（近身） →↓←→·J或U
*大招 雷光拳↓→↓→·J或U
大發電者（近身）（→↓←）*2·J或U
鬼燃燒 →↓→·J或U （對空）
獨樂屠 ←↓←·K或I （對地）
琴月陽 →↓←·K或I （從過去打）
七拾五式改 ↓→·K·K或I·I （踢飛）
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