SNK PLAYMORE在MVS基板上制作的KOF系列最後一部作品，拳皇2003(KOF2003)依然繼承了三對三的組隊模式，不過對戰模式發生了變化，三名隊員同時上場，玩家們可以看到畫面中體現的是三排血槽，可是對戰時間依然還是60秒，第一位隊員被擊敗後，下一個隊員會立即登場，直到KO對方三名隊員，或者是時間結束。
在人物設定方面，拳皇2003(KOF2003)在加入了新角色的同時，也恢複了大部分角色的老面孔，從這點來說是否意味著SNK真正的回歸？在戰鬥模式上，拳皇2003(KOF2003)依然繼承了三對三的組隊模式，不過對戰模式發生了變化，三名隊員同時上場，玩家們可以看到畫面中體現的是三排血槽，可是對戰時間依然還是60秒（不過比起以前會慢很多），第一位隊員被擊敗後，下一個隊員會立即登場，直到KO對方三名隊員，或者是時間結束。
不過當能量槽出現CHANGEOK時可以變換出場隊友，CD換上一名隊友，BC換下一名隊友，至此KOF系列通用的CD超重擊被取消。
換而代之的是消耗CHANGEOK和能量槽的超重擊，可以破壞對手的防禦，令對手産生硬直時間，並受到己方另一位隊員的登場攻擊。連續技方面也發生了變化，並增加了隊長必殺技這一設定。SNK的再次回歸讓我們看到了幾乎全新的KOF，期盼創新的KOF2003能夠再次成爲拳皇系列的又一座裏程碑。
全世界最高級別的格鬥大會，"THEKINGOFFIGHTERS"在這個舞台上，盧卡爾被擊倒了，大蛇被封印了。強大的NESTS也被打敗了。無數的故事在上演。然而，公衆看不到的真相總被遮掩在厚厚的幕帳後面。
即使是這樣，今年的拳皇KOF大會(2003)也決定召開了。今年的大會同樣也是神秘的主辦者。各種流言滿天飛舞。盡管如此，一個又一個的熟悉面孔再一次地出現在大會上。
之前小心謹慎的媒體，在得知許多著名的格鬥家都參加了大會後，也關注起比賽了。
這次的大會宣布的了新的規則："multi-shift"。新規則允許選手在戰鬥中自由的更換上場人員。這很快的成爲了世界討論的焦點。新規則需要更敏捷的戰鬥，更注意組隊的策略。報紙、雜志以及電視每天都在激烈的爭論著新規則。"這個世界上還有許多強大的格鬥家"，Gato,Tizoc,DuoLon（多龍）,ShenWoo（神武），以及AshCrimson。
隨著這次大會引起的喧鬧，這些人的名字也越來越被人熟悉。毫無疑問，互聯網起了相當大的作用。這些競爭者會成爲KOF大會亮麗的新星嗎？或者？大會的准備也在這些瘋狂的日子中有條不紊的繼續著。
預選比賽地點決定了，時間表也制定了。觀衆們也隨著預選賽的進行從這裏趕到那裏。
爲了創造街頭格鬥的氣氛，比賽的地點都在城市的中心。成千上萬的觀衆湧入各地的體育館觀看巨大的電視屏幕現場轉播的比賽。
2003年12月。比賽的日子來臨了。今年，大賽的帷幕再次升起。
打最終boss
拳皇2003有2個最終boss，一個是愛迪爾（怒加的兒子），另一個是無界（遙彼系列的人物）打出他們的條件
第4戰面對幻の草薙京，如果用消耗能量的攻擊（換人攻擊也算的）打死他，那麽最終boss就是無界；反之則是愛迪爾。
而遊戲的結局乃至官方完整隊伍結局則必須擊敗無界後才能看到；若最終boss是愛迪爾，那麽打倒他後直接宣布“gameover"選擇最終boss
注：此秘籍PS2版限定
將遊戲通關，如果通關流程最終boss是愛迪爾的話，通關後解開愛迪爾，在八神庵頭像上按R1即可選出最終boss是無界的話，通關後解開無界，在草薙京頭像上按R1即可選出選擇隱藏人物
神樂千鶴：在任意位置輸入↑↖←↙↓↘→↗→↘↓↙+任一鍵幻の草薙京：在任意位置輸入↓↙←↖←↙↓↘→↗+任一鍵注：最後一個方向鍵要拉住的時候選人
PS2版可直接選擇幻の草薙京和神樂雙子
