拳皇99Remix Pro是拳皇99的一個修改版本，此版本中大多數招式釋放速度加快，且可以選擇拳皇99最後boss的兩種變身形態，MAX變爲按雙鍵耗費三管氣槽發動，還在等什麽趕快下載加入激烈的拳皇格鬥之中吧！
KOF的故事在97年打倒大蛇後似乎就已經結束了。K'也接替了草薙京以及八神庵的主角地位，K'的身份無從參考，似乎是WHIP的弟弟？KOF99再次放棄前作成熟的系統，沒有了模式選擇，而改爲所有人物通用的最大蓄滿三顆寶珠的能量槽。並且取消了能量槽的繼承系統。縮短了緊急回避的距離，加快了緊急回避的時間。並且向後回避時會向前小跳躍。同時可以CANCEL必殺技和超必殺。KOF系列也首次引入STRIKER和SUPER CANCEL的概念，並且新增爆氣發動的反擊模式和防護模式。
本遊戲的操作類似于KOF99，部分性能仿KOF2000，大幅度變動有：
1. 取消閃避移動攻擊，返回到正常的緊急閃避功能；
2. 可通過按START鍵挑撥對手將一管氣槽轉化爲一個援助點；
3. 援助可在攻擊時隨時呼出，投技後可呼叫援助將對手擊飛；
4. CM和AM模式發動瞬間都有無法防禦的攻擊判定；
5. 瀕死狀態發動MAX的限**消，MAX變爲按雙鍵耗費三管氣槽發動；
6. 草剃京1號和草剃京2號合爲草剃一個角色，與2002中草剃性能相當
7. 大多數招式釋放速度加快，性能接近于2000。並且可以選擇99的BOSS最終的兩種形態。
出招表中符號代表含義如下：
△普通投技 ◆特殊技 ●必殺技 ★超必殺技 ★★★MAX超必殺技
【EDIT角色】
KYO
△釟鐵：近敵時→ or ← + C
△一刹背負投：近敵時→ or ← + D
◆轟斧陽：→ + B
◆奈落落：跳躍中↓ + C
◆八十八式：↘ + D
●百式·鬼燒：→↓↘ + A or C
●七百七式·獨樂屠：←↓↙ + B or D
●七十五式·改：↓↘→ + B or D ->B or D
●四百二十七式·铄鐵：→↘↓↙← + B or D（原輕重攻擊調換，輕攻擊類似2000以後性能）
●百十四式·荒咬：↓↘→ + A
●百二十八式·九傷：荒咬動作中↓↘→ + A or C
●百二十七式·八锖：九傷動作中A or C
●百二十五式·七濑：九傷動作中B or D（移動距離變短）
●百二十七式·八锖：荒咬動作中→↘↓↙← + A or C
●百二十五式·七濑：八锖動作中B or D（移動距離變短）
●外式·砌穿：八锖動作中A or C
● 百十五式·毒咬：↓↘→ + C
●四百一式·罪詠：毒咬動作中→↘↓↙← + A or C
●四百二式·罰詠：罪詠動作中→ + A or C
●百式·鬼燒：罰詠動作中→↓↘ + A or C
●九百十式·鶴摘（外式·虎伏/龍射）：↓↙←+A or C
★百八拾貳式：↓↘→↓↘→ + A or C（可蓄力，蓄滿破防）
★裏百八式·大蛇剃：↓↙←↙↓↘→ + A or C（啓動加快）
★★★裏百八式·大蛇剃：↓↙←↙↓↘→ + AC（啓動加快）
援助性能：跟隨我方角色的所在位置出現，蓄力後釋放大蛇剃。在這個版本裏，KYO的大蛇剃援助可以把尚未落至地面的對手給燒起來，不管離地面的距離到底有多低（只要不是0），可以帶來很多連擊的機會。
例：K’近C-熱動（同時呼叫KYO）-KYO援助擊中後熱動
IORI
△逆剝：近敵時→ + C
△逆逆剝：近敵時→ + D
◆外式·夢彈：→ + A -> A
◆外式·轟斧陰·[url=]死神[/url]：→ + B（變快）
◆外式·百合折：跳躍中← + B
●百式·鬼燃燒：→↓↘ + A or C
●二百十二式·琴月陰 ：→↘↓↙← + D or B（我把B和D反過來是爲了防和諧……坑爹的百度）
●屑風：近敵 →↘↓↙←→ + A or C
●三百十一式·抓節：→↓↘ + B or D（可追加葵花）
●百八式·暗勾手 ↓↘→ + A or C
●百二十七式·葵花：↓↙← + A or C
●百式·鬼燃燒：葵花第二次輸入後→↓↘ + A or C
●二百十二式·琴月陰 ：葵花第二次輸入後→↘↓↙← + B or D
★禁千二百十一式·八稚女：葵花前二段中↓↘→↘↓↙← + A or C（非CM狀態需耗費2能量點）
★裏三百十一式·祈抓節：↓↘→↓↘→ + B or D
★禁千二百十一式·八稚女：↓↘→↘↓↙← + A or C
★★★裏三百十六式·豺華：八稚女最後↓↘→↓↘→ + AC（CM中不可，需2能量點）
★★★禁千二百十一式·八稚女：↓↘→↘↓↙← + AC
援助性能：跟隨我方角色的所在位置出現，接觸到對手時有一次攻擊判定，之後使用八酒杯。可以接住落下的對手，也可以把倒地的對手燒起至站立定身狀態，但是要注意當八酒杯的定身狀態消失後，對手的硬直會立刻解除。
例：KYO鬼燒（同時呼叫IORI）-對手落下至八酒杯上出現定身狀態時出MAX大蛇剃
草剃
△釟鐵：近敵時→ + C
△一刹背負投：近敵時→ + D
◆轟斧陽：→ + B
◆奈落落：跳躍中↓ + C
◆砌穿：↘ + C （DOWN攻擊）
●鬼燒：→↓↘ + A or C
●胧車：→↓↘ + B or D
●暗拂：↓↘→+A or C（DOWN攻擊性能取消）
●七十五式·改：↓↘→+B or D -> B or D
●琴月陽：→↘↓↙←+B or D
★大蛇剃：↓↙←↙↓↘→ + A or C
★★★最終決戦奧義·零式：↓↘→↓↘→ + AC
援助性能：從我方身後使出七百七式·獨樂屠，擊中對手倒地，未擊中時接著出七十五式改。可對地追加，注意只有當七十五式改兩段都擊中時才能使得後面有足夠的高度連上一些超必殺。
例：東丈近B-虎膝撞同時呼叫草剃-草剃七十五式改擊中時MAX死亡龍卷風
Krizalid（變身前）
△DEAD FALL：近敵時→ + C or D
●NEGATIVE ANGUISH：↓↘→ + A or C
●DEMON LANDING：空中↓↘→+B or D
援助性能：于屏幕中偏向玩家的一側空中落下並使用DEMON LANDING，之後使用NEGATIVE ANGUISH。共三段的攻擊使得很容易在中間插入連技，另外在NEGATIVE ANGUISH之後是可以追加的。
例：IORI近C同時呼叫Krizalid - DEMON LANDING擊中後二段葵花（第一段未擊中） - NEGATIVE ANGUIOS擊中後八稚女。
Krizalid（變身後）
△DEAD FALL：近敵時→ + C or D
◆CUTPIN：→ + A
●TYPHON'S RAGE：↓↘→ + A or C
●LETHAL IMPACT：↓↘→ + B or D
●RISING DARK MOON：→↓↘ + A or C
●DESPERATE MOMENT：→↘↓↙← + A or C（Moment PENETRATION變爲自動發出）
●●RISING DARK MOON：DESPERATE MOMENT轉身後→↓↘ + A or C（不可CANCEL MAX版超必殺）
★END OF HEAVEN：↓↙←↙↓↘→ + A or C
★DESPERATE OVERDRIVE：↓↘→↘↓↙← + A or C
★★★END OF EDEN：↓↙←↙↓↘→ + AC
★★★DESPERATE OVERDRIVE：↓↘→↘↓↙← + AC
援助性能：從玩家身後快速前沖使用END OF EDEN MAX版，大約三分之二的屏幕都是有效攻擊距離，命中後對手浮空。在空中可用的追打判定時間較少，不使用一些對空判定強的技能就可能連不上。
例：King近C - MIRAGE KICK快結束時呼叫Krizalid - END OF EDEN擊中後ILLUSION DANCE MAX版。
【K’隊】
K’
△SPORT PILE： 近敵時→ + C
△KNEE STRIKE： 近敵時→ + D
◆一英寸： → + A
◆膝擊： → + B（變快）
●熱**： ↓↘→ + A or C（出手變快，能接在輕攻擊後）
●第二彈： EIN TRIGGER中：→ + B
●第二盾： EIN TRIGGER中：→ + D（對空性能弱化，取消角落無限連）
●瞬刺： EIN TRIGGER中：← + B or D
●烏鴉咬：→↓↘ + A or C（A出增加1Hit，C出高度增加）
●追加攻擊： 重CROW BITE中→ + B or D
●瞬刺： ↓↙← + B or D（空中可）
●暗匿： ↓↘→ + B or D（B出移動距離變短）
★鏈動： ↓↘→↘↓↙← + A or C （出手變快）
★熱動 ：↓↘→↓↘→ + A or C
★★★超鏈動： ↓↘→↘↓↙← + AC（攻擊力下降）
援助性能：對手在地面時：狹刺攻擊，可對地追加；對手在空中時：輕烏鴉咬，擊中浮空。
例：①KYO C發鬼燒，同時呼叫K’ - 烏鴉咬擊中後MAX大蛇剃。
②KYO七百七式?獨樂屠，同時呼叫K’ – 狹刺擊中後MAX大蛇剃（稍蓄力）。
MAXIMA
△DYNAMITE DROP： 近敵時→ + C
△CHALKING VICE： 近敵時→ + D
◆MONGOLIAN： → + A （連擊中變快）
◆M9型 MAXIMA MISSILE SCRAMBLE： ↘ + C （連擊中變快）
●M-4型 VAPOR CANNON： ↓↙← + A or C（輕出變快，格擋判定削除）
●SYSTEM 1：MAXIMA SCRAMBLE ↓↘→ + A
●DOUBLE BOMBER SYSTEM：MAXIMA SCRAMBLE中↓↘→ + A
●BULLDOG PRESS： DOUBLE BOMBER中↓↘→ + A
●SYSTEM 2：MAXIMA SCRAMBLE ↓↘→ + C
●SCULL CRUSH SYSTEM 2：MAXIMA SCRAMBLE中↓↘→ + C
●CE**ON PRESS： SCULL CRUSH中→ + B or D
●M-11型 DANGEROUS ARCH： 近敵時←↙↓↘→ + B or D
★BUNKER BUSTER： ↓↘→↘↓↙← + A or C（發動時的DOWN攻擊判定削除）
★MAXIMA'S REVENGE： 近敵時→↘↓↙← →↘↓↙← + B or D
★★★MAXIMA'S REVENGE： 近敵時→↘↓↙← →↘↓↙← + BD
（備注：近C只第一Hit可取消）
援助性能：從玩家身後降下至對手身前，使用SYSTEM 1：MAXIMA SCRAMBLE將對手抓起，有對地追加判定，但與距離有關（過遠會抓不起來）。
例：二階堂紅丸 近C - 真空片手駒快結束時呼叫MAXIMA – MAX雷光拳。
二階堂紅丸
△抓擊：近敵時→ + C
△前抓擲：近敵時→ + D
△旋轉膝落：空中近敵時↑以外 + C or D
◆捷克小刀踢：→ + B（變快）
◆飛行訓練：跳躍中↓ + D
●雷刃拳：↓↘→ + A or C
●空中雷刃拳：跳躍中↓↘→ + A or C
●真空片手駒：↓↙← + A or C
●稻妻腳：→↓↘ + B or D
●居合蹴：↓↘→ + B or D
●反動三段蹴：居合蹴中↓↙← + B or D（2002性能）
★幻影飓風：↓↙←↓↙← + B or D
★雷光拳：↓↘→↓↘→ + A or C（發動變快）
★★★雷光拳：↓↘→↓↘→ + AC
援助性能：從玩家身後跳出並使用發電者抓取對手一段時間，沒有傷害，感覺沒什麽威脅……
例：Terry近C同時呼叫紅丸 – A發火焰沖拳擊中，紅丸援助的發電者抓取成立 – MAX能量噴泉。
矢吹真吾
△釟鐵： 近敵時→ + C
△一刹背負投： 不完全 近敵時→ or ← + D
◆外式 轟斧：→ + B
●百式 鬼燒： 未完成 →↓↘ + A or C
●百拾四式： 荒咬 未完成 ↓↘→ + A
●百拾五式： 毒咬 未完成 ↓↘→ + C（隨機出現2Hit攻擊，有火焰效果—第1Hit任意取消）
●百壹式： 胧車 未完成 ←↓↙ + B or D
●真吾KICK： ←↙↓↘→ + B or D
●真吾謹制 俺式 錵研： 近敵時→↓↘ + B or D
●貳百拾貳式 琴月： 未完成 →↘↓↙← + B or D
★外式 驅鳳麟： ↓↘→↓↘→ + A or C （跑動變快）
★燃燒真吾： ↓↙←↙↓↘→ + A or C
★★★燃燒真吾： ↓↙←↙↓↘→ + AC
援助性能：于玩家身後前沖後抓住對手的腳，定住對手2秒左右（即使矢吹真吾放開了手，對手仍有一段時間硬直狀態），注意在放開手後的硬直狀態中才能使用亂舞技類型的超殺進行連段，否則會強制終止超殺。
例：K’ 熱**同時呼叫矢吹真吾 - 第二彈擊中，真吾的援助攻擊判定中挑釁 – 真吾放開手的那一段硬直時間中超鏈動。
